Perteneciente a una familia de cartógrafos, en 1906 se ordena sacerdote de la Congregación Salesiana. Al ingresar a la orden, la sede principal se ha incendiado, por lo que se decide realizar misiones intinerantes. Así es como de Agostini llegar a Chile y a Argentina, en donde recurre las partes más sureñas y en donde realiza expediciones científicas, escalando montañas, fotografiando y filmando. En 1910 empieza a fotografiar el Río Grande y la isla Dawson. Con esa información edita en Turín su libro Mis viajes a Tierra del Fuego en 1924, la cual contiene 124 fotografías. A partir de 1918 filma diversos cortos documentales, los cuales compila y ordena en 1933 estrenando Tierras magallánicas.